2010 – Certificação em Boas Práticas de Fabricação (BPF) do prédio de Penicilínicos;
2012 – Início das operações na Fábrica de Medicamentos em Moçambique;
2013 – O antimalárico Artesunato + Mefloquina (ASMQ) é incluído na lista de medicamentos essenciais da Organização Mundial da Saúde (OMS);
2014 – Unidade conquistou a categoria Ouro no Prêmio da Qualidade PQ Rio;
Registro de oito medicamentos;
Início da implementação do novo sistema operacional da unidade ERP / SAP;
2015 – Farmanguinhos foi a primeira instituição pública a conquistar a Certificação Ambiental Internacional, ISO 14001;
2017 – Readequação da planta fabril e liberação da linha do Tacrolimo;
2018 – O Instituto formaliza cinco novas Parcerias de Desenvolvimento Produtivo. A lista inclui produtos de primeira linha contra HIV/Aids, hepatite C e para evitar rejeição de órgãos transplantados.